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wentao edited this page Aug 18, 2020 · 1 revision

Welcome to the ggClusterNet wiki!

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写在前面

微生物生态学领域对于网络的追求就像是人类对对航天的追求,弄不清楚,但是充满兴趣。对于微生物组数据做网络分析,充满着机会和挑战。多种多样的网络构建方法,检测方法,可视化方法出现,并且依赖的平台也不太统一。整合起来将是一个巨大的难题。

目前我们将一下几个部分进行一个汇总,以R语言作为媒介进行整理,将逐渐包含以下几个方面的内容。ggClusterNet正在发展,相关功能正在完善,希望大家可以提出需求。留言盖楼。

项目可以在我的github主页上查看: https://github.com/taowenmicro/ggClusterNet

网络构建

  • 逐渐整合多种网络计算方法;

网络可视化

  • 主要设计按照分组展示网络,毛线球拆分成不同的模块展示;
  • 网络标记,等

网络属性,节点属性,整体网络属性

  • 多种节点属性计算,包括度,中心性等;
  • 网络属性,模块性的等;

随机网络与生态学网络

  • 随机网络计算;
  • 微生物网络与随机网络显著性;
  • 幂律分布及其可视化;

网络模块化

  • 模块化计算;
  • ZiPi计算可视化;

网络HUB节点

  • 基于多种算法的HUB节点计算;

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