updated preface & some minor issues

hcp4715 · Sep 9, 2024 · 983bc7d · 983bc7d
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diff --git a/Book/00-author.Rmd b/Book/00-author.Rmd
@@ -0,0 +1,5 @@
+# 关于作者 {-}
+
+胡传鹏(<http://huchuanpeng.com>), 南京师范大学心理学院教授。\
+
+开放科学的支持者，开放科学中文社区(Chinese Open Science Network)的发起人之一。\
diff --git a/Book/1008-lesson8_2024.Rmd b/Book/1008-lesson8_2024.Rmd
@@ -431,15 +431,14 @@ knitr::include_graphics('pic/chp8/SPSS.png')
 
 这种情况下，我们需要更深入地理解平方和的计算方法，以便正确解读R的输出结果。这也是我们在使用R进行统计分析时，需要不断强化统计知识的一个重要原因。因为相比于SPSS这类点击式操作的软件，R提供了更多的选项，而正确理解和使用这些选项，就需要我们对统计学有更深入的理解。
 
-我们是否能得到完全相同的结果呢？实际上，这是完全可能的。例如，我们可以使用afex这个包，这是在2017或2018年后出现的一个包。afex是为了满足实验心理学家进行方差分析的需求而设计的，其中包含了各种方差分析的功能。如果我们按照这样的写法，即将被试的identity写在这里，然后将类型设置为三，我们就能得到完全相同的结果。我们也可以在其他地方使用同样的方法，同样能得到一模一样的结果。
-
 [car::Anova()]
 ```{r}
 # 结果不一致，原因PPT显示不全，请回到rmd文档查看
 aov1 <- car::Anova(stats::aov(Temperature ~ climate * romantic, data = df))
 aov1
 ```
 我们是否能得到完全相同的结果呢？实际上，这是完全可能的。例如，我们可以使用afex这个包，这是在2017或2018年后出现的一个包。afex是为了满足实验心理学家进行方差分析的需求而设计的，其中包含了各种方差分析的功能。如果我们按照这样的写法，即将被试的identity写在这里，然后将类型设置为三，我们就能得到完全相同的结果。我们也可以在其他地方使用同样的方法，同样能得到一模一样的结果。
+
 ```{r}
 # 原因debug
 # 查看R的默认对比设置
@@ -560,6 +559,7 @@ res1 <- bruceR::MANOVA(data = df,
                        dv = "Temperature", 
                        between = c("climate", "romantic"))
 ```
+
 ```{r,echo=FALSE}
 res1 %>%
   capture.output()
@@ -582,6 +582,7 @@ res1 %>%
 然后，我们通过改变分组条件，看了在不同climate下，恋爱关系是否有影响。结果显示，在热带和温带，恋爱关系没有显著影响，但在寒带，恋爱关系则有显著影响。这个结果与我们的预期相符，表明在较冷的气候下，恋爱关系对体温有调节作用。
 
 此外，我们还进行了F检验，实际上是在热带、温带和寒带三种条件下进行了单因素方差分析。由于只有两个水平（恋爱和单身），所以这个F检验的结果与后面的t检验结果基本一致。这是因为在只有两个水平的情况下，F检验和t检验的结果是一样的。如果你对这个有兴趣，你可以进一步查看t值和F值之间的关系。
+
 ```{r, results='asis'}
 sim_eff <- res1 %>% 
   bruceR::EMMEANS("climate", by = "romantic") %>%
@@ -616,4 +617,4 @@ res2 <- bruceR::MANOVA(
 
 最后，我们留了一个思考题：对于重复测量设计（within-subject design），如何用回归模型进行分析？此外，我们还给出了一些课堂练习，建议大家尝试自己编写代码来完成这些练习，以加深对课程内容的理解。
 
-本节课在此结束。感谢大家的参与，如果有任何问题，请随时提问。
+本节课在此结束。感谢大家的参与，如果有任何问题，请随时提问。
diff --git a/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-255-1.png b/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-255-1.png
diff --git a/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-275-1.png b/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-275-1.png
diff --git a/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-277-1.png b/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-277-1.png
diff --git a/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-278-1.png b/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-278-1.png
diff --git a/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-286-1.png b/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-286-1.png
diff --git a/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-287-1.png b/Book/_book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-287-1.png
diff --git a/Book/_book/index.html b/Book/_book/index.html
diff --git a/Book/_book/lesson-1.html b/Book/_book/lesson-1.html
diff --git a/Book/_book/lesson-5.html b/Book/_book/lesson-5.html
diff --git a/Book/_book/reference-keys.txt b/Book/_book/reference-keys.txt
@@ -1,4 +1,3 @@
-id_0-index
 开放电子书的初衷
 如何帮助完善本书
 使用许可

diff --git a/Book/_book/references.html b/Book/_book/references.html
diff --git a/Book/_book/search_index.json b/Book/_book/search_index.json
diff --git a/Book/_book/关于作者.html b/Book/_book/关于作者.html
diff --git a/Book/_book/第七讲描述性统计与数据可视化基础.html b/Book/_book/第七讲描述性统计与数据可视化基础.html
diff --git a/Book/_book/第三讲git-rstudio工作流.html b/Book/_book/第三讲git-rstudio工作流.html
diff --git a/Book/_book/第九讲回归模型二分层线性模型.html b/Book/_book/第九讲回归模型二分层线性模型.html
diff --git a/Book/_book/第二讲如何开始使用r.html b/Book/_book/第二讲如何开始使用r.html
diff --git a/Book/_book/第八讲回归模型一.html b/Book/_book/第八讲回归模型一.html
diff --git a/Book/_book/第六讲数据预处理.html b/Book/_book/第六讲数据预处理.html
diff --git a/Book/_book/第十一讲回归模型四中介分析.html b/Book/_book/第十一讲回归模型四中介分析.html
diff --git a/Book/_book/第十三讲基于网络模型的心理学研究.html b/Book/_book/第十三讲基于网络模型的心理学研究.html
diff --git a/Book/_book/第十二讲数据可视化进阶.html b/Book/_book/第十二讲数据可视化进阶.html
diff --git a/Book/_book/第十四讲心理学元分析入门.html b/Book/_book/第十四讲心理学元分析入门.html
diff --git a/Book/_book/第十讲回归模型三广义线性模型.html b/Book/_book/第十讲回归模型三广义线性模型.html
diff --git a/Book/_book/第四讲如何导入数据.html b/Book/_book/第四讲如何导入数据.html
diff --git a/Book/_book/补充1如何进行基本的数据分析-相关与回归.html b/Book/_book/补充1如何进行基本的数据分析-相关与回归.html
diff --git a/Book/_book/补充2从分析到手稿.html b/Book/_book/补充2从分析到手稿.html
diff --git a/Book/_book/补充3效应量和元分析.html b/Book/_book/补充3效应量和元分析.html
diff --git a/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-255-1.png b/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-255-1.png
diff --git a/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-275-1.png b/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-275-1.png
diff --git a/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-277-1.png b/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-277-1.png
diff --git a/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-278-1.png b/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-278-1.png
diff --git a/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-286-1.png b/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-286-1.png
diff --git a/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-287-1.png b/Book/_main_files/figure-html/unnamed-chunk-287-1.png
diff --git a/Book/index.Rmd b/Book/index.Rmd
@@ -16,7 +16,17 @@ link-citations: yes
 knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
 ```
 
-# 引言 {#0-index}
+# 引言 {-}
+
+本电子书通过[`bookdown`](https://bookdown.org/)进行创建，由于文字稿来自于对课堂录音的整理，加之本人时间不多，因此，可能存在如下问题：
+
+-   文字口语化严重
+-   图片或者文献引用不全
+-   错别字等
+
+望读者朋友多多包涵。欢迎有兴趣有能力的朋友多多批评指正。指出问题的方式：在本电子书的GitHub仓库的[issues](https://github.com/hcp4715/R4PsyBook/issues)中开新的issue。
+
+参与贡献方式：见下面《如何帮助完善本书》这一小节。
 
 ## 开放电子书的初衷
 分享知识，向众多开源的电子书作者致敬，为中文心理学领域略尽绵薄之力。
@@ -28,10 +38,45 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
 
 第一，创建github账号，然后fork这个项目。\
 第二，将fork后的项目clone到您自己的电脑上。\
-第三，在自己的电脑上使用Rstudio打开这个项目，然后修改您想要修改的内容。\
+第三，在自己的电脑上使用Rstudio打开`Book`这个文件夹中的`Book.Rproj`，完善您觉得需要完善的内容。*\
 第四，将修改后的内容push到您的github上。\
 第五，在github上提交pull request。\
 
+
+\* 本项目的文件夹结构如下，内容修改主要在`Book`这个子文件夹下的`100*-lesson*_2024.rmd`文件。
+
+```
+.
+├── Book
+│   ├── 1001-lesson1_2024.Rmd
+│   ├── 1002-lesson2_2024.Rmd
+│   ├── 1003-lesson3_2024.Rmd
+│   ├── 1004-lesson4_2024.Rmd
+│   ├── 1005-lesson5_2024.Rmd
+│   ├── 1006-lesson6_2024.Rmd
+│   ├── 1007-lesson7_2024.Rmd
+│   ├── 1008-lesson8_2024.Rmd
+│   ├── 1009-lesson9_2024.Rmd
+│   ├── 1010-lesson10_2024.Rmd
+│   ├── 1011-lesson11_2024.Rmd
+│   ├── 1012-lesson12_2024.Rmd
+│   ├── 1013-lesson13_2024.Rmd
+│   ├── 1014-lesson14_2024.Rmd
+│   ├── 1015-lesson15_2023.Rmd
+│   ├── 1016-lesson16_2023.Rmd
+│   ├── 1017-lesson17_2023.Rmd
+|   ├── ...
+|
+│   ├── data
+│   │   ├── Template_Folder_System_Empirical_Chuan-Peng_Lab
+│   │   ├── Template_Folder_System_Meta_Chuan-Peng_Lab
+│   │   ├── match
+│   │   └── penguin
+│
+├── LICENSE.md
+├── R4PsyBook.Rproj
+└── README.md
+```
 ## 使用许可
 
 本电子书使用CC4.0作为使用许可，如果您使用本电子书内容，请规范引用。

diff --git a/Book/output/chp8/Corr.md b/Book/output/chp8/Corr.md
@@ -1,5 +1,5 @@
 Descriptive Statistics and Correlation Matrix:
-✔ Table saved to "/Users/hcp4715/Downloads/Book/./output/chp8/Corr.doc"
+✔ Table saved to "/Users/hcp4715/Library/CloudStorage/OneDrive-Personal/Teaching/Grad_R_course/R4PsyBook/Book/./output/chp8/Corr.doc"
 
 Correlation matrix is displayed in the RStudio `Plots` Pane.
 
diff --git a/Book/output/chp8/Lm.md b/Book/output/chp8/Lm.md
@@ -1,2 +1,2 @@
-✔ Table saved to '/Users/hcp4715/Downloads/Book/./output/chp8/Lm.doc'
+✔ Table saved to '/Users/hcp4715/Library/CloudStorage/OneDrive-Personal/Teaching/Grad_R_course/R4PsyBook/Book/./output/chp8/Lm.doc'
 
diff --git a/Book/pic/chp12/p1.pdf b/Book/pic/chp12/p1.pdf
diff --git a/Book/rsconnect/documents/index.Rmd/bookdown.org/hcp4715/R4PsyBook.dcf b/Book/rsconnect/documents/index.Rmd/bookdown.org/hcp4715/R4PsyBook.dcf
@@ -5,6 +5,6 @@ account: hcp4715
 server: bookdown.org
 hostUrl: https://bookdown.org/__api__
 appId: 13774
-bundleId: 100415
+bundleId: 100422
 url: https://bookdown.org/hcp4715/R4PsyBook/
 version: 1
diff --git a/README.md b/README.md
@@ -1,22 +1,22 @@
 # R语言在心理学研究中的应用: 从数据到论文(2024版)
 
-本repo用于将《R语言在心理学研究中的应用》一课的内容转化为文字版，并形成一本在线的bookdown电子书。
+本repo用于将《R语言在心理学研究中的应用》一课的内容转化为文字版，并通过[`bookdown`](https://bookdown.org/)这一R包形成一本在线的bookdown电子书。
 
 课程相关的repo：[https://github.com/hcp4715/R4Psy](https://github.com/hcp4715/R4Psy)
 
 在线电子书地址：[https://bookdown.org/hcp4715/R4PsyBook/](https://bookdown.org/hcp4715/R4PsyBook/)
 
-由于文字稿来自于对课堂录音的整理，而且第一版中我们只有精力完成的课堂内容的文字转换，因此，可能存在如下问题：
+由于文字稿来自于对课堂录音的整理，而且目前我们主要只能完成的课堂内容的文字转换，因此，可能存在如下问题：
 
 -   文字口语化严重
 -   图片或者文献引用不全
 -   错别字等
 
-欢迎小伙伴对文字进行修改，并通过pull request的方式参与整理和完善本电子书。
+欢迎各位一起完善，共同将这个电子书变得更好，贡献方式见[这里](https://bookdown.org/hcp4715/R4PsyBook/#%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%B8%AE%E5%8A%A9%E5%AE%8C%E5%96%84%E6%9C%AC%E4%B9%A6)。
 
 ## 作者信息
 
-胡传鹏（教授），南京师范大学心理学院；
+胡传鹏（教授），南京师范大学心理学院。
 
 ### V2 版本(2024春季学期)得到以下同学的大力协助：
 
@@ -30,15 +30,15 @@
 - 司远宁，信阳师范大学教育科学学院硕士生；
 - 武婷婷，南京师范大学心理学院硕士生；
 - 温佳慧，南京师范大学心理学院硕士生；
-- 亓鹤潼， 南京师范大学文学院硕士生；
+- 亓鹤潼，南京师范大学文学院硕士生；
 - 陈逸群，南京师范大学心理学院硕士。
 
 
 ### V1 版本(2023春季学期)得到以下助教同学的大力协助：
 
-- 蔡 镇， 南京师范大学心理学院硕士生（2021级）；
-- 柏松石， 南京师范大学心理学院本科生（2020级）；
-- 孙禾嘉， 南京师范大学心理学院本科生（2020级）。
+- 蔡  镇, 南京师范大学心理学院硕士生（2021级）
+- 柏松石, 南京师范大学心理学院本科生（2020级）
+- 孙禾嘉, 南京师范大学心理学院本科生（2020级）
 
 ## 使用许可/LICENSE
Original file line number	Diff line number	Diff line change
		@@ -1,2 +1,2 @@
		✔ Table saved to '/Users/hcp4715/Downloads/Book/./output/chp8/Lm.doc'
		✔ Table saved to '/Users/hcp4715/Library/CloudStorage/OneDrive-Personal/Teaching/Grad_R_course/R4PsyBook/Book/./output/chp8/Lm.doc'