Este repositorio contiene tres módulos introductorios y obligatorios para el desarrollo de los cursos Bioinformática para el análisis de SARS-CoV-2 para principiantes y Vigilancia genómica de S.pneumoniae y S. agalactiae
Módulo 1: Introducción a Google Colaboratory
Para comenzar, vaya a https://colab.research.google.com/.
En la página de inicio de Colab, seleccione "Archivo" y luego "Abrir bloc de notas".
Hay una pestaña para "GitHub"; seleccione esa pestaña y pegue la siguiente URL en la barra de búsqueda debajo de "Ingresa una URL de GitHub o realiza una búsqueda por organización o usuario":
https://github.com/cabana-online/Tutorial_Introduccion
Después de una breve búsqueda verá el notebook:
01.Intro_a_colab.ipynb
Seleccione y verá el notebook abierto.
Para ejecutar las celdas, deberá iniciar sesión con su cuenta de Google (es libre de hacer una cuenta). El uso de Colab es gratis.
Nota: existen limitaciones en la versión gratuita, pero no serán alcanzadas en este curso.
Módulo 2: Introducción a Notebooks y Unix/Linux
Vaya a https://colab.research.google.com/.
Seleccione el repositorio
https://github.com/cabana-online/Tutorial_Introduccion
Después de una breve búsqueda verá el notebook:
02.Modulo_2_linux.ipynb
Seleccione y verá el notebook abierto.
Módulo 3: Introducción a las tecnologías de NGS
Vaya a https://colab.research.google.com/.
Seleccione el repositorio
https://github.com/cabana-online/Tutorial_Introduccion
Después de una breve búsqueda verá el notebook:
03.Modulo_3_NGS.ipynb
Seleccione y verá el notebook abierto.