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HiDaisyYu · Oct 20, 2022 · 1b23b8f · 1b23b8f
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diff --git a/deprecated_tests/tests_software_single.py b/deprecated_tests/tests_software_single.py
@@ -65,6 +65,7 @@ def tearDown(self):
 		pass
 
 
+
 	def test_get_species_tag(self):
 		"""
 		test SARS cov 
@@ -152,4 +153,8 @@ def test_get_species_tag(self):
 		except Reference.DoesNotExist:
 			self.assertFail("Record must exist")
 
-		self.assertEqual(Reference.SPECIES_SARS_COV_2, reference_test.specie_tag)
+		self.assertEqual(Reference.SPECIES_SARS_COV_2, reference_test.specie_tag)
+
+
+
+
diff --git a/static/db/contigs2sequences/sequences_v8.fasta b/static/db/contigs2sequences/sequences_v8.fasta
diff --git a/static/db/type_identification/db_influenza_typing_v9.fasta b/static/db/type_identification/db_influenza_typing_v9.fasta
diff --git a/static/tests/db/type_identification/test_covid_typing.fasta b/static/tests/db/type_identification/test_covid_typing.fasta
@@ -50,5 +50,5 @@ ATGAGTAGTAAAACTACACCAGCACCAGTTTATATCTGGACTGCTGATGAAGCTATTAAATTCCTAAAGGAATGGAATTT
 ATGTTATTAATTATTTTTATTTTGCCTACAACATTAGCTGTTATAGGTGATTTTAATTGTACTAACTCTTTTATTAATCATTATAATAAAACCATTCCGCGTATAAGCGAGGATGGTGTTGATGTATCTCTTGGTTTGGGCACATATTATGTTCTTAATCGTGTTTATTTAAATACTACCTTGTTATTTACAGGTTATTTTCCTAAATCTGGTGCTAATTTTACAGACTTGGCTTTAAAGGGTTCTACATATTTGAGTACTCTCTGGTATAAACCACCTTTTCTGTCAGATTTTAATAATGGTATTTTTTCTAAGGTTAAGAATACTAAGTTATATGTTAATAATATTTTGTATAGTGAATTTAGTACTATAGTTATAGGTAGTGTTTTTGTTAATACGTCTTATACTATTGTTGTTCAACCTCACAATGGTATTTTGGAGATTACAGCTTGTCAGTATACTATGTGTGAATATCCTCACACTGTTTGTAAGTCTAAGGGTAGTATTCGTAATGAATCTTGGCACATTGATTCTTCGGAACCTTTATGCTTGTTTAAGAAAAATTTTACTTATAATGTTTCTGCAGATTGGCTGTATTTTCATTTTTATCAAGAACGTGGTGTTTTTTATGCATATTATGCAGATGTAGGTATGCCTACCACTTTTTTATTTAGTTTATATTTAGGTACTATTTTATCTCATTATTATGTTATGCCTTTGACTTGTAATGCTATATCTCCAAAGACTGACAAAGAAACTTTAGAATATTGGGTTACACCGCTATCTAGACGTCAGTATCTTCTCAATTTTGATGAGCACGGTGTTATTACTAAAGCCGTTGATTGTTCAAGTAGTTTTCTTAGTGAGATTCAATGTAAAACTCAATCTTTTGCACCTAATACTGGTGTTTATGATTTGTCTGGTTTTACTGTAAAGCCTGTTGCAACTGTTTATCGTCGGATTCCTAATTTACCTGATTGTGACATTGACAACTGGCTTAATAATGTTAGTGTACCTTCACCTCTTAATTGGGAACGTAGAATTTTTTCTAATTGTAACTTCAATTTAAGCACTTTACTTCGTCTAGTCCATGTTGATTCTTTTTCTTGTAATAATCTTGATAAATCTAAAATTTTTGGTAGTTGCTTTAATAGTATTACTGTTGACAAGTTTGCTATACCTAATCGTAGACGAGATGATTTGCAATTGGGCAGTTCTGGCTTTTTGCAATCATCTAATTACAAAATAGATACTACTTCTAGTTCTTGTCAATTGTATTATAGTTTGCCTGCAATTAATGTTACTATTAATAATTATAATCCTTCTTCTTGGAATAGAAGGTATGGTTTTAATAATTTTAATTTGAGCTCTCATAGTGTTGTTTACTCACGTTATTGTTTTTCTGTTAATAATACTTTTTGTCCTTGTGCTAAACCTTCTTTTGCTTCAAGTTGCAAGAGTCATAAACCACCTTCTGCTTCCTGTCCTATTGGTACTAAATATCGTCATTGCGACTTGGATACTACTCTTTATGTTAAAAACTGGTGTAGATGTTCTTGTCTACCTGACCCCATTTCTACTTATTCTCCTAACACATGTCCTCAAAAGAAGGTCGTTGTTGGTATAGGTGAACATTGTCCAGGTCTTGGTATTAATGAGGAAAAATGTGGTACACAATTAAATCATAGTTCCTGTTCTTGTAGTCCTGATGCCTTTTTGGGTTGGTCTTTTGATAGTTGTATTAGTAATAATCGTTGCAATATTTTTTCTAATTTTATTTTTAATGGAATTAATAGTGGTACCACTTGTTCTAATGATTTGTTATATTCTAACACTGACGTTTCTACTGGTGTTTGTGTTAATTATGATCTTTATGGCATCACAGGCCAAGGTATTTTTAAAGAAGTTTCTGCGGCTTATTATAATGATTGGCAGAATCTTTTGTATGATTCTAATGGTAATATTATTGGTTTTAAAGATTTTTTGACTAATAAAACTTACACTATACTTCCTTGTTATTCTGGTAGAGTGTCTGCTGCATTTTATAAAAATTCTTCCTCACCAGCTTTGCTTTATCGTAATTTAAAGTGTAGTTATGTTTTGAATAATATTTCTTTTATCTCACAACCATTTTATTTTGATAGTTATCTTGGTTGTGTTTTGAATGCTGTTAATTTAACTAGCTATTCTGTATCCTCTTGTGATTTGCGTATGGGTAGTGGGTTTTGTATTGATTATGCTTTACCCTCTTCTCGGCGTAAGCGTAGAGGTATTTCTTCTCCTTATCGCTTTGTAACTTTTGAACCCTTTAATGTTAGTTTTGTTAACGATAGTGTTGAAACTGTAGGTGGTTTATTTGAGATTCAGATTCCTACTAACTTTACCATAGCTGGTCATGAAGAATTTATTCAGACTAGTTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTTCAGCTTTTGTTTGCTCTAATTATGCTGCTTGTCATGATTTATTGTCGGAATATGGCACTTTTTGCGATAATATTAATAGTATTTTAAATGAAGTCAATGACTTACTTGATATTACTCAGTTGCAGGTTGCTAATGCTTTAATGCAAGGTGTTACACTTAGTTCTAATCTTAATACTAATCTACACTCTGATGTTGATAATATAGATTTTAAATCTCTTCTAGGTTGTTTAGGTTCACAATGTGGTTCTTCGTCTAGATCTTTGTTAGAGGATTTATTATTCAACAAGGTCAAACTTTCAGATGTAGGTTTTGTTGAAGCTTATAATAATTGCACTGGTGGTAGTGAAATTAGAGATCTTCTCTGTGTGCAATCTTTTAATGGTATTAAAGTATTACCTCCCATTTTATCAGAGACTCAAATTTCTGGTTATACTACAGCTGCTACTGTGGCGGCTATGTTTCCGCCATGGTCTGCTGCTGCTGGTGTACCATTTTCTCTTAATGTACAATATAGAATTAATGGTTTGGGTGTTACTATGGATGTTCTTAATAAGAATCAAAAGTTAATAGCTAATGCTTTTAATAAAGCTCTTCTTTCTATCCAGAATGGTTTTACTGCTACTAACTCTGCTCTTGCTAAAATTCAAAGTGTCGTTAATGCTAATGCTCAAGCACTTAATAGTTTGTTACAACAATTATTTAATAAATTTGGTGCTATTAGTTCTTCTTTACAAGAAATTTTGTCTCGCCTTGATAATTTAGAAGCTCAGGTTCAGATTGATAGGCTCATTAATGGTCGTTTGACTGCTTTAAATGCTTATGTTTCTCAACAGCTTAGTGATATTACACTTATTAAGGCTGGAGCTTCTCGTGCTATTGAGAAGGTTAATGAGTGTGTTAAAAGTCAATCCCCTCGTATAAATTTTTGTGGCAATGGTAACCACATTTTATCATTGGTTCAAAATGCTCCTTATGGTTTGCTTTTCATTCATTTTAGTTATAAACCTACTTCTTTTAAAACTGTCTTAGTAAGTCCAGGTTTATGTTTATCCGGTGATATAGGTATTGCACCTAAGCAAGGTTATTTTATTAAACAAAATGATTCCTGGATGTTTACTGGTAGTTCCTATTATTACCCAGAACCAATTTCAGATAAAAATGTTGTTTTCATGAATAGTTGCTCTGTTAATTTTACTAAAGCTCCATTTATTTATCTTAATAATTCTATACCAAATTTGTCTGATTTTGAAGCCGAGTTTTCTCTTTGGTTTAAAAATCATACTTCTATAGCACCTAATTTAACCTTTAATTCTCATATTAATGCTACTTTTTTAGATCTGTATTATGAAATGAATGTTATTCAGGAATCTATTAAATCTTTGAACAGTAGTTTTATTAATCTTAAAGAAATAGGTACTTATGAAATGTATGTTAAATGGCCTTGGTACATTTGGTTGTTAATTGTCATTTCATTTATAATTTTTCTTATGATACTTTTCTTTATATGCTGCTGTACTGGTTGCGGTTCAGCATGTTTTAGTAAATGTCATAATTGTTGTGATGAGTATGGGGGTCACAATGATTTTGTTATTAAAGCATCTCATGATGATTAG
 >coronavirus_genus~~~BetaCoV~~~M_gene_MK167038
 ATGAATGAATCAATTTTTCCTCATTGGAATTCTGATCAAGCTATTACATTCTTAAAAGAATGGAATTTCTCTTTGGGTGTAATATTACTTCTCATTACTATCATACTGCAGTTTGGTTATACGAGCCGTAGTATGTTTGTTTATCTTATTAAGATGAGTATTCTTTGGCTTATGTGGCCATTGACCATTATCTTGACTATATTTAATTGCTTTTATGCTTTGAATAATATCTTTCTTGGGCTTTCTATACTGTTTACTATTATTTCTATTGTTATATGGATTTTATATTTTGTCAACAGTATTCGGCTTTTTATTAGAACTGGCAGTTGGTGGAGTTTTAACCCAGAGACTAATAATCTTATGTGTATTGATATGAAAGGTAAGATGTATGTTAGGCCAGTTATTGAGGACTATCATACATTAACGGCTACTGTTATCCGTGGTCATCTTTATATACAGGGTGTTAAACTTGGCACTGGTTACACGCTTGCTGATTTGCCTGTTTATGTTACTGTAGCTAAGGTGCAAGTCCTCTGTACTTATAAACGTGCCTTTTTAGATAAGTTAGATGTTAATAGTGGCTTTGCTGTTTTTGTTAAGTCTAAAGTTGGTAACTATCGTTTACCTTCTAGTAAATCTAGTGGTATGGATACTGCCTTGTTGAGAGCTTAA
->monkeypox_species~~~MPVX~~~rpo18_gene_ON649720
+>monkeypox_species~~~MPXV~~~rpo18_gene_ON649720
 ATGTCGAGCTTTGTTACCAATGGATATCTTCCAGTTACATTGGAACCACATGAGTTGACGTTAGACATAAAAACTAATATTAGGAATGCCGTATATAAGGCGTATCTCCATAGAGAAATTAGTGGTAAAATGGCCAAGAAAATAGAAATTCGTGAAGACGTGGAATTACCTCTCGGTGAAATAGTTAATAATTCTGTAGTTATAAACGTTCCGTGTGTAATAACCTACGCATATTATCACGTTGGGGATATAGTCAGAGGAACATTAAACATCGAAGATGAATCAAATGTAACTATTCAATGTGGAGATTTAATCTGTAAACTAAGTAGAGATTCGGGTACTGTATCATTTAGCGATTCAAAGTACTGCTTTTTTCGAAATGGTAATGCGTATGATAACGGCATCGAAGTCTCCGCCGTTCTAATGGAGGCTCAACAAGGTACCGAATCTAGTTTTGTTTTTCTCGCGAATATCGTTGACTCATAA