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DawnEve/bioToolKit

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二代测序分析工具箱
v0.1

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包含:
	脚本、代码(写好注释,写清楚版本号和依赖及其版本号)
	测试数据(控制在100k以内)
	在线工具集导航页
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生信分析最佳实践
	R_scripts/src/readMe.txt

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shell 常用代码片段


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Python常用代码片段
	Python3_pieces.txt
	downLoad_zhaows.py 多线程下载上万个文件,用py控制并发下载的数量
	concurrence_demo.py 自己写的py并发框架,todo: 包装成更好用的py包。
	txtBBS.py 自己写的简易BBS系统,能发言,记录IP,基于txt文件。
	markdownReader.py 自己写的简易markdown文档阅读器,单文档阅读。
	snakemake/ 添加流程
		微生物 meta分析:跟着science学习宏基因组-原流程
		GATK4 分析 germline mutation
	IF/IF2html.py  生成影响因子网页


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R常用代码片段
	QC for geneChips 
	heatmap: R_scripts\visulization\pheatmap_demo-ForSunjiaxin.R
		# More CMD: http://www.360doc.com/content/14/1103/10/17553313_422108323.shtml

	ggplot2_dplyr/
		101-barchart.R
	heatmap_for_pValue: 热图,要根据P值的显著程度设置颜色。使用image()函数实现了精美版v1和批量版v2
		R_scripts\visulization\heatmap_for_pValue

	R_pieces.txt 
		maximal number of DLLs reached... 
	index.html 专题:ggplot2画SCI中常见的图 http://tool.biomooc.com/R_scripts/
	
	for ZDJY:
		R_scripts/zdjy_2018/wangcc_SNP_Indel_filterBy3Rules.R
	批量小提琴图:
		R_scripts/visulization/batch-violinPlot-for_WangXuefei.R
	火山图
	雷达图



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js常用代码片段
	JavaScript/sankey/index.html 桑基图
	JavaScript/mathJax_demo.html LaTeX Math Preview 预览数学公式
	JavaScript/markdownReader/index_md.html  预览 markdown 文件
	JavaScript/code_reader.html 预览 R code on Server件
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Java常用代码片段



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