Structure

📦scripts
├── 📜draw_functions.R
├── 📜helpers.R
├── 📜master.R
├── 📂other
│   ├── 📂importations
│   │   ├── 📜helpers.R
│   │   └── 📜importations.R
│   ├── 📂kappa_count
│   │   └── 📜kappa_count.R
│   ├── 📂reproduction_number
│   │   ├── 📜helpers.R
│   │   ├── 📜Re.R
│   │   ├── 📜Re_matrix.R
│   │   └── 📜Rgamma.R
│   ├── 📂serial_interval
│   │   └── 📜serial_interval.R
│   └── 📂truncated_tree
│       ├── 📜helpers.R
│       └── 📜master.R
├── 📂outbreaker
│   ├── 📜ESS.R
│   ├── 📜helpers.R
│   ├── 📜outbreaker.R
└── 📜sensitivity.R