update aroE and arcC alleles

B-UMMI · Jul 24, 2019 · 2d10170 · 2d10170
1 parent a2c0d15
commit 2d10170
Showing 1 changed file with 18 additions and 18 deletions.
diff --git a/ReMatCh/modules/mlst_schemas/staphylococcus_aureus.fasta b/ReMatCh/modules/mlst_schemas/staphylococcus_aureus.fasta
@@ -62,24 +62,24 @@ TATAAACATACATTTAATATTGGTTGTGCAATTGCAATTGTTGTAGTTATTATTACTTTGATTTT
 >aroE
 CCCTGGTAAACAAACATATCTAAGCCATTATAAATATGGTTTCCCTTGCGCTCTGCTTCCTCTAAAATAGGTGTTTTATA
 CGGTATATAAACAATATCACTCATTAAAGTATTGGGAGAAAGATGCTTTAAATTAATAATACTTTCGTTATTTCCAGCCA
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-TTTAAATTCCAAGATTCAAAACGAGCCATCGTTCTATTCGCAACAGTTAATTTGGGCTTTACAAATTTTGCTAATTCATA
-AGCAATACCTTTACTTGCACCACCTGCGCCCAAAATTAAAATGTATGCATTTTCTAAATCTGGATAAACGCTGTGCAATC
-CTTTAACATAACCAATACCATCTGTATTATACCCTATCCACTTGCCATCTTTTATCAAAACAGTGTTAACTGCACCTGCA
-TTAATCGCTTGTTCATCAACATAATCTAAATACGGTATGATACGTTCTTTATGAGGAATTGTGATATTAAAGCCTTCTAA
-TTCTTTTTTCGAAATAATTTCTTTAATTAAATGAAAATCTTCAATTGGAATATTTAAAGCTTCATAAGTATCATCTAATC
-CTAAAGAATTAAAATTTGCTCTATGCATAACGGGCGACAAGGAATGTGAAATAGGATTTCCTATAACTGCAAATTTCATT
+TACCCGCTGGTGTTGTATTAATAACGATATCGAATTCAGCAATTTTAATTCTTTAGGATTAGATGATACTTATGAAGCTT
+TAAATATTCCAATTGAAGATTTTCATTTAATTAAAGAAATTATTTCGAAAAAAGAATTAGATGGCTTTAATATCACAATT
+CCTCATAAAGAACGTATCATACCGTATTTAGATCATGTTGATGAACAAGCGATTAATGCAGGTGCAGTTAACACTGTTTT
+GATAAAAGATGACAAGTGGATAGGGTATAATACAGATGGTATTGGTTATGTTAAAGGATTGCACAGCGTTTATCCAGATT
+TAGAAAATGCATACATTTTAATTTTGGGCGCAGGTGGTGCAAGTAAAGGTATTGCTTATGAATTAGCAAAATTTGTAAAG
+CCCAAATTAACTGTTGCGAATAGAACGATGGCTCGTTTTGAATCTTGGAATTTAAATATAAACCAAATTTCATTAGCAGA
+TGCTGAAAAGTATTTATGCTCTATGCATAACGGGCGACAAGGAATGTGAAATAGGATTTCCTATAACTGCAAATTTCATT
 TTTTTAATCACCTTATAAAATAGAATTTCTTAATACAACATCAACATTTTTAGGAACACGAACGATTACTTTAGCCCCTG
 GTCCTATAGTTATAAAGCCTAGACCAGAGATCATAACATCGCGTTTCTCTTTGCCT
 >arcC
-ATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTACCTTGTGCCGCGTATTTTTTCAGTGTTGCTACATCAATATCATCGAT
-TTGTTGTTGATTAGGTTCATTAAAGTTAATAAATACATTTTCTACATTCGTAAGAATCATTAAGGTATCTGCTTCAATCA
-GCGTTGCTAATTTCTCACTAGCAAAATCTTTATCTATAACCGCTTCAACACCTTCATAGGTATTTTCTTTTTTTATAACT
-GGAATACCGCCACCACCGCATGCAATGACAATATTTTTACCGTCTGCTAAAGTTCGAATTAACTGGTGTTCTAGTATAGA
-TTGAGGTAGTGGTGACGCAACTACTTTTCTATAACCACGTCCTGCATCTTCTTTAAAGACTGAGTCTGGCTGTTCTTTTT
-GTAATTCTTCAACTTCTTCTTTCGTATAAAAAGGACCAATTGGTTTAGTTGGGTTATCAAATCGTGGATCATCTTTATCT
-ACTTCCACACGTGTAACGATTGTGCCTACAGTTCTATCACTATTCATTTCAGTTAAAATGCGATTGATTTCAGTTTCCAA
-CCAATAGCCTATCATACCCTGTGACATTGCACCACAAGTATCCAATGGCATTGCCGGCGTTGTGTCACTGTTCGATTTAG
-CTTGTTGGATTAATAAACTTCCAATTTGTGGACCATTACCATGTGAAATCACAATACGCGCTGGTGAATCAAATAAAGGT
-TTAAGGTTTTGCATCGCACATCTAATAGCTGTTTGTTGTGCTTCAGCTGTTGCTTCTGTTGTCTGTATCGCATTACCGCC
-TAATGCAATGACAATTTTCTCTTTCATATTTTTGTCGCTCCTTTTAAAAAACATTT
+ATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTACCTTGTGCCGCGTATTTTTTCAGTGTTGCTACATCAATATCATCGATT
+TGTTGTTGATTAGGTTCATTAAAGTTAATAAATACATTTTCTACATTCGTAAGAATCATTAAGGTATCTGCTTCAATCAGC
+GTTGCTAATTTCTCACTAGCAAAATCTTTATCTATAACTTATTAATCCAACAAGCTAAATCGAACAGTGACACAACGCCGG
+CAATGCCATTGGATACTTGTGGTGCAATGTCACAGGGTATGATAGGCTATTGGTTGGAAACTGAAATCAATCGCATTTTAA
+CTGAAATGAATAGTGATAGAACTGTAGGCACAATCGTTACACGTGTGGAAGTAGATAAAGATGATCCACGATTCAATAACC
+CAACCAAACCAATTGGTCCTTTTTATACGAAAGAAGAAGTTGAAGAATTACAAAAAGAACAGCCAGACTCAGTCTTTAAAG
+AAGATGCAGGACGTGGTTATAGAAAAGTAGTTGCGTCACCACTACCTCAATCTATACTAGAACACCAGTTAATTCGAACTT
+TAGCAGACGGTAAAAATATTGTCATTGCATGCGGTGGTGGCGGTATTCCAGTTATAAAAAAAGAAAATACCTATGAAGGTG
+TTGAAGCGACTTCCAATTTGTGGACCATTACCATGTGAAATCACAATACGCGCTGGTGAATCAAATAAAGGTTTAAGGTTT
+TGCATCGCACATCTAATAGCTGTTTGTTGTGCTTCAGCTGTTGCTTCTGTTGTCTGTATCGCATTACCGCCTAATGCAATG
+ACAATTTTCTCTTTCATATTTTTGTCGCTCCTTTTAAAAAACATTT