Este repositorio contiene códigos de programación en lenguaje R para realizar un análisis GWAS con el paquete rMVP.
El set de datos proviene del tutorial para el software TASSEL (Bradbury, 2007). Los datos, que se pueden obtener aquí, consisten en genotipos SNPs (m = 3093 marcadores) de 281 individuos de maíz (número haploide de cromosomas x= 10). Las variables fenotípicas son EarHT: altura de mazorca; dpoll: tiempo (días) a florecer; EarDia: diámetro de mazorca.
Referencia: Bradbury, P.J., Zhang Z., Kroon D.E., Casstevens T.M., Ramdoss Y., y Buckler E.S. (2007). TASSEL: Software for association mapping of complex traits in diverse samples. Bioinformatics 23:2633-2635.
