From e87b46f663f059d537ca7b8289a7311590308bfd Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: nayib-jose-gloria <55710092+nayib-jose-gloria@users.noreply.github.com> Date: Mon, 11 Nov 2024 00:24:41 +0000 Subject: [PATCH] chore: update ontology descendant mappings Signed-off-by: github-actions[bot] <41898282+github-actions[bot]@users.noreply.github.com> --- ontology-assets/cell_type_descendants.json | 434 ++++++++++----------- ontology-assets/tissue_descendants.json | 147 ++++++- 2 files changed, 333 insertions(+), 248 deletions(-) diff --git a/ontology-assets/cell_type_descendants.json b/ontology-assets/cell_type_descendants.json index f7d07623..a95ec6fa 100644 --- a/ontology-assets/cell_type_descendants.json +++ b/ontology-assets/cell_type_descendants.json @@ -23,6 +23,7 @@ "CL:0002320": [ "CL:0000057", "CL:0000058", + "CL:0000060", "CL:0000062", "CL:0000134", "CL:0000135", @@ -77,6 +78,7 @@ "CL:1000309", "CL:1000311", "CL:1000692", + "CL:1000742", "CL:1001318", "CL:1001607", "CL:1001609", @@ -90,6 +92,7 @@ "CL:4023056", "CL:4028004", "CL:4028006", + "CL:4030022", "CL:4033016", "CL:4033018", "CL:4033026", @@ -116,6 +119,8 @@ "CL:0000861", "CL:0000863", "CL:0000864", + "CL:0000866", + "CL:0000867", "CL:0000875", "CL:0000878", "CL:0000879", @@ -139,22 +144,25 @@ "CL:0002470", "CL:0002477", "CL:0002629", + "CL:0009008", "CL:0009038", "CL:0011031", "CL:1000353", "CL:1000695", "CL:1000698", + "CL:1000742", "CL:1001603", "CL:2000055", "CL:3000001", "CL:4033042", - 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"CL:4033043" + "CL:4033043", + "CL:4033068", + "CL:4033069", + "CL:4033070" ], "CL:0000325": [ "CL:0000091", @@ -1447,6 +1427,8 @@ "CL:0000861", "CL:0000863", "CL:0000864", + "CL:0000866", + "CL:0000867", "CL:0000875", "CL:0000878", "CL:0000879", @@ -1482,6 +1464,7 @@ "CL:0002586", "CL:0002617", "CL:0002629", + "CL:0009008", "CL:0009038", "CL:0011004", "CL:0011031", @@ -1490,6 +1473,7 @@ "CL:1000458", "CL:1000695", "CL:1000698", + "CL:1000742", "CL:1001603", "CL:2000055", "CL:2000092", @@ -1497,14 +1481,14 @@ "CL:4033013", "CL:4033042", "CL:4033043", - "CL:4033056" + "CL:4033056", + "CL:4033070" ], "CL:0000349": [ "CL:0000351", "CL:0000525", "CL:0002488", "CL:0008036", - "CL:0009092", "CL:0011101", "CL:2000002", "CL:2000060" @@ -1521,10 +1505,10 @@ "CL:0000388", "CL:0000650", "CL:0000669", - "CL:0000676", "CL:0002503", "CL:0002547", "CL:0009089", + "CL:1000742", "CL:1001318", "CL:2000043" ], @@ -1576,12 +1560,15 @@ "CL:0000669", "CL:0000881", "CL:0002539", + "CL:0002590", "CL:0002591", "CL:0005021", "CL:0005022", "CL:0008034", + "CL:0008035", "CL:0009089", "CL:0019018", + "CL:1000742", "CL:1001318", "CL:2000043" ], @@ -1601,14 +1588,17 @@ "CL:0001042", "CL:0001043", "CL:0001044", + "CL:0001087", "CL:0001204", "CL:0002038", + "CL:0002436", "CL:0002677", "CL:0002678", "CL:4033038" ], "CL:0000625": [ "CL:0000794", + "CL:0000795", "CL:0000900", "CL:0000906", "CL:0000907", @@ -1620,6 +1610,7 @@ "CL:0001050", "CL:0001062", "CL:0001203", + "CL:0002437", "CL:4033039" ], "CL:0000084": [ @@ -1633,6 +1624,7 @@ "CL:0000791", "CL:0000792", "CL:0000794", + "CL:0000795", "CL:0000796", "CL:0000798", "CL:0000800", @@ -1678,11 +1670,15 @@ "CL:0001049", "CL:0001050", "CL:0001062", + "CL:0001087", "CL:0001203", "CL:0001204", "CL:0002038", "CL:0002419", "CL:0002420", + "CL:0002428", + "CL:0002436", + "CL:0002437", "CL:0002489", "CL:0002496", "CL:0002677", @@ -1691,7 +1687,8 @@ "CL:0011024", "CL:0011025", "CL:4033038", - 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"CL:4033039" + "CL:4033039", + "CL:4033068", + "CL:4033069" ], "CL:0000738": [ "CL:0000084", @@ -1941,6 +1950,7 @@ "CL:0000791", "CL:0000792", "CL:0000794", + "CL:0000795", "CL:0000796", "CL:0000798", "CL:0000800", @@ -1969,6 +1979,8 @@ "CL:0000861", "CL:0000863", "CL:0000864", + "CL:0000866", + "CL:0000867", "CL:0000875", "CL:0000878", "CL:0000879", @@ -2044,6 +2056,7 @@ "CL:0001080", "CL:0001081", "CL:0001082", + "CL:0001087", "CL:0001203", "CL:0001204", "CL:0002038", @@ -2061,6 +2074,9 @@ "CL:0002399", "CL:0002419", "CL:0002420", + "CL:0002428", + "CL:0002436", + "CL:0002437", "CL:0002457", "CL:0002461", "CL:0002470", @@ -2070,6 +2086,7 @@ "CL:0002629", "CL:0002677", "CL:0002678", + "CL:0009008", "CL:0009038", "CL:0009111", "CL:0009112", @@ -2088,7 +2105,10 @@ "CL:4033038", "CL:4033039", "CL:4033042", - "CL:4033043" + "CL:4033043", + "CL:4033068", + "CL:4033069", + "CL:4033070" ], "CL:0000763": [ "CL:0000038", @@ -2132,6 +2152,8 @@ "CL:0000861", "CL:0000863", "CL:0000864", + "CL:0000866", + "CL:0000867", "CL:0000875", "CL:0000878", "CL:0000879", @@ -2152,7 +2174,6 @@ "CL:0002154", "CL:0002193", "CL:0002355", - 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"CL:4023070", "CL:4023083", "CL:4023120", "CL:4023121", @@ -2599,6 +2632,8 @@ "CL:4033034", "CL:4033035", "CL:4033036", + "CL:4033046", + "CL:4033047", "CL:4033051", "CL:4033052", "CL:4033053" @@ -2606,6 +2641,7 @@ "CL:0000669": [ "CL:0000650", "CL:0009089", + "CL:1000742", "CL:1001318", "CL:2000043" ], @@ -2658,6 +2694,7 @@ "CL:4023056", "CL:4028004", "CL:4028006", + "CL:4030022", "CL:4033026" ], "CL:0000152": [ @@ -2665,9 +2702,9 @@ "CL:0002064", "CL:0002325", "CL:0002623", + "CL:1001596", "CL:4033005", - "CL:4033037", - "CL:4033058" + "CL:4033037" ], "CL:0000163": [ "CL:0000164", @@ -2699,6 +2736,7 @@ "CL:0000071", "CL:0000131", "CL:0000132", + "CL:0000666", "CL:0000704", "CL:0002138", "CL:0002139", @@ -2728,12 +2766,14 @@ "CL:1000892", "CL:1001005", "CL:1001033", + "CL:1001036", "CL:1001096", "CL:1001099", "CL:1001131", "CL:1001285", "CL:1001567", "CL:1001568", + "CL:1001572", "CL:1001602", "CL:2000008", "CL:2000016", @@ -2747,21 +2787,32 @@ "CL:4033008" ], "CL:0002076": [ + "CL:0000082", + "CL:0000083", "CL:0000155", "CL:0000158", "CL:0000162", + "CL:0000169", + "CL:0000171", + "CL:0000173", "CL:0000209", "CL:0000307", + "CL:0000322", "CL:0000508", "CL:0000510", "CL:0000577", "CL:0000584", "CL:0000682", + "CL:0002062", + "CL:0002063", + "CL:0002064", "CL:0002071", "CL:0002075", + "CL:0002079", "CL:0002145", - "CL:0002149", + "CL:0002178", "CL:0002179", + "CL:0002180", "CL:0002203", "CL:0002204", "CL:0002207", @@ -2775,6 +2826,7 @@ "CL:0002257", "CL:0002258", "CL:0002260", + "CL:0002275", "CL:0002278", "CL:0002293", "CL:0002328", @@ -2785,12 +2837,15 @@ "CL:0002364", "CL:0002365", "CL:0002368", + "CL:0002370", + "CL:0002480", "CL:0002563", "CL:0002621", "CL:0002623", "CL:0002632", - "CL:0002633", "CL:0002657", + "CL:0005019", + "CL:0008024", "CL:0009006", "CL:0009009", "CL:0009016", @@ -2799,11 +2854,16 @@ "CL:0009041", "CL:0009042", "CL:0009043", + "CL:0009070", + "CL:0009071", + "CL:0009073", "CL:0009080", "CL:0011108", + "CL:0017000", "CL:0019003", "CL:0019031", "CL:0019032", + "CL:1000143", "CL:1000312", "CL:1000320", "CL:1000326", @@ -2812,62 +2872,33 @@ "CL:1000342", "CL:1000343", "CL:1000347", - "CL:1000348", "CL:1000349", "CL:1000353", "CL:1000495", + "CL:1001433", "CL:1001516", + "CL:1001576", "CL:1001589", + "CL:1001596", "CL:4030023", "CL:4033037", "CL:4033044", "CL:4033048" ], "CL:0002078": [ - 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