From 649ed4743040de0144c175d4b5a52cc44d9e2d9f Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: birdflyi <1065168006@qq.com> Date: Wed, 10 Aug 2022 20:47:41 +0800 Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?Update=EF=BC=9A=E6=9B=B4=E6=96=B0=20=E4=BB=8E?= =?UTF-8?q?=E7=A7=91=E5=AD=A6=E8=B5=B7=E6=BA=90=E7=9C=8B=E4=BA=A4=E5=8F=89?= =?UTF-8?q?=E5=AD=A6=E7=A7=91.md=EF=BC=8C=E5=90=88=E5=B9=B6=EF=BC=88?= =?UTF-8?q?=E9=9D=9E=E8=9E=8D=E5=90=88=EF=BC=89v1.0=E7=9A=84=E8=AE=A4?= =?UTF-8?q?=E7=9F=A5=E6=B5=81=E7=A8=8B=E8=A7=86=E8=A7=92=E5=92=8Cv1.1?= =?UTF-8?q?=E7=9A=84=E6=95=B0=E6=8D=AE=E7=BB=93=E6=9E=84=E8=A7=86=E8=A7=92?= =?UTF-8?q?=E5=85=A5=E6=AD=A4=E6=96=87=E6=A1=A3=E3=80=82?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- ...44\345\217\211\345\255\246\347\247\221.md" | 39 ++++++++++++++++--- 1 file changed, 34 insertions(+), 5 deletions(-) diff --git "a/\344\273\216\347\247\221\345\255\246\350\265\267\346\272\220\347\234\213\344\272\244\345\217\211\345\255\246\347\247\221.md" "b/\344\273\216\347\247\221\345\255\246\350\265\267\346\272\220\347\234\213\344\272\244\345\217\211\345\255\246\347\247\221.md" index b42be6b..0b96074 100644 --- "a/\344\273\216\347\247\221\345\255\246\350\265\267\346\272\220\347\234\213\344\272\244\345\217\211\345\255\246\347\247\221.md" +++ "b/\344\273\216\347\247\221\345\255\246\350\265\267\346\272\220\347\234\213\344\272\244\345\217\211\345\255\246\347\247\221.md" @@ -28,6 +28,39 @@ Jim Gray提出的第一范式至第四范式：   研究形式按技艺精准程度划分。 其中**研究对象**继续细分： + +**a.按认知流程划分** + +- 实体（节点划分）：整体【如[达尔文式盖亚](https://weibo.com/5062669769/LtNDRkPmv)】、个体、局部 +- 联结（网络链接）：功能角色【客观需求】、结构特性【主观偏好】、交互方式【矛盾分析与模式识别】 +- 流程（流图路径）：产出成果【布局策略】、投入资源【级联传播】、关键事件【平衡调控与时序演化】 + +与5W1H的对应关系： + +实体-事实-What +联结-原理-Why +流程-应用-How + +What Why How每个方面划分的依据都可以包括Who Where When的属性。 + +认知流程指如何从Who Where When等属性记录的事实数据样本，找出其中的模式遵循的原理，再将原理通过已有模式应用于流程拟合，得出What Why How三个层次之间的定性或定量映射。 + +划分参考： + +- 参考战略兵法 + 实体：镇国家，抚百姓，给馈饷，不绝粮道。 + 联结：运筹策帷帐之中，决胜于千里之外；知彼（功能角色）知己（结构特性）者，百战不怠（交互方式）。 + 流程：连百万之军，战必胜，攻必取。 +> “夫运筹策帷帐之中，决胜于千里之外，吾不如子房。镇国家，抚百姓，给馈饷，不绝粮道，吾不如萧何。连百万之军，战必胜，攻必取，吾不如韩信。此三者，皆人杰也，吾能用之，此吾所以取天下也。”——西汉·司马迁《史记·高祖本纪》 +> “知彼知己者，百战不殆。不知彼而知己，一胜一负；不知彼，不知己，每战必殆。”——《孙子兵法·谋攻篇》 + +- 参考史书体例 + 记事视角：纪传体（Who）、国别体（Where）、编年体及断代史体例及通史（When）、纪事本末体（What, How）、典章体（What）、史论及史评（Why） + +研究对象按联结划分示例：动机分析中的联结、自主、胜任，分别对应客观（功能角色）、主观（结构偏好）、平衡（交互方式）视角。 + +**b.按关系结构划分** + - 实体（节点划分）：整体【聚类类比如[达尔文式盖亚](https://weibo.com/5062669769/LtNDRkPmv)】、个体【元素表征】、局部【交叉映射】 - 流程（流图路径）：前驱【特征聚合】、后继【级联传播】、关键事件【时序演化】 - 层次（层级组织）：双亲【分类回归】、孩子【概率生成】、组织策略【评估与决策】 @@ -44,10 +77,6 @@ Jim Gray提出的第一范式至第四范式：   其中聚类->度量->分类->建模，是依次支撑的。在数据的特征维度不断升高时，对数据碰撞的处理需要不断增加建模复杂度，即从集合到序列到树到图甚至到图模式，能表达的规律是从节点特征到位置到状态到过程到甚至到过程模式。 -研究对象按联结划分示例： - -  动机分析中的联结、自主、胜任，分别对应客观（功能角色）、主观（结构偏好）、平衡（交互活动）视角。 - ## **1.2 科研的动机** ### 1.2.1 个人层面 @@ -136,7 +165,7 @@ Jim Gray提出的科学范式见1.1，包括实验观测(Empirical)、理论推   交叉：基因组学和蛋白质组学等的原理（NP部分）和信息科学分析（E部分）与基因组学和蛋白质组学等的数据（NH部分）   目前的研究方向主要有：序列比对、序列组装、基因识别、基因重组、蛋白质结构预测、基因表达、蛋白质反应的预测，以及分子进化模型 -**研究对象**： +**研究对象（按关系结构划分）**：   实体：序列、基因、蛋白质、实体之间的交叉（如基因重组）   流程：序列比对、进化演化