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#print(out)
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## treeWAS output ##
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####################
## All findings: ##
####################
Number of significant loci: [1] 0
########################
## Findings by test: ##
########################
####################
## terminal test ##
####################
Number of significant loci:
[1] 0
Significance threshold:
99.99957%
0.2547805
########################
## simultaneous test ##
########################
Number of significant loci:
[1] 0
Significance threshold:
99.99957%
3
######################
## subsequent test ##
######################
Number of significant loci:
[1] 0
Significance threshold:
99.99957%
81.26668
#print(out2)
####################
## treeWAS output ##
####################
####################
## All findings: ##
####################
Number of significant loci: [1] 2
Significant loci:
[1] "NEIS2490" "NEIS2902"
########################
## Findings by test: ##
########################
####################
## terminal test ##
####################
Number of significant loci:
[1] 0
Significance threshold:
99.99957%
0.2248062
########################
## simultaneous test ##
########################
Number of significant loci:
[1] 2
Significance threshold:
99.99957%
2.983336
Significant loci:
SNP.locus p.value score G1P1 G0P0 G1P0 G0P1
NEIS2490 488 0 -3.5 4 49 15 61
NEIS2902 698 0 -3.5 4 49 15 61
######################
## subsequent test ##
######################
Number of significant loci:
[1] 0
Significance threshold:
99.99957%
81.48891